水樣首入曝氣筒，置換掉上次的水樣，然后進行計量，利用鹽酸進行曝氣，去除水樣中的無機碳。采用氮氣進行載氣；平時紅外線分析儀得到的氮氣都是通過燃燒和除濕器供給的，并且燃燒時為了紅外線分析儀的氣室潔凈和實現(xiàn)低溫燃燒，要將載氣供應(yīng)停止燃燒系統(tǒng)的密封狀態(tài)。然后對密封的燃燒系統(tǒng)注入少量的不含無機碳的水樣，讓其在規(guī)定的時間內(nèi)進行650℃的低溫燃燒。燃燒結(jié)束后，將燃燒系統(tǒng)的密封狀態(tài)解除，燃燒后的有機污染物生成的氣體隨載氣進入除濕器，導(dǎo)入紅外線分析儀。利用紅外線分析儀將生成的氣體中的二氧化碳的濃度測出，形成電信號，再將其進行零點自動補償，用峰值信號或者曲線圖來進行標示該電信號和記錄該TOC的濃度。

　　按測定TOC值的不同原理又可分為差減法和直接法兩種。

　　1、差減法測定TOC值的方法原理：水樣分別被注入高溫燃燒管(900℃)和低溫反應(yīng)管(150℃)中。經(jīng)高溫燃燒管的水樣受高溫催化氧化，使有機化合物和無機碳酸鹽均轉(zhuǎn)化成為二氧化碳。經(jīng)反應(yīng)管的水樣受酸化而使無機碳酸鹽分解成為二氧化碳，其所生成的二氧化碳依次導(dǎo)入非分散紅外檢測器，從而分別測得水中的總碳(TC)和無機碳(IC)。總碳與無機碳之差值，即為總有機碳(TOC)。

　　2、直接法測定TOC值的方法原理：將水樣酸化后曝氣，使各種碳酸鹽分解生成二氧化碳而驅(qū)除后，再注入高溫燃燒管中，可直接測定總有機碳。但由于在曝氣過程中會造成水樣中揮發(fā)性有機物的損失而產(chǎn)生測定誤差，因此其測定結(jié)果只是不可吹出的有機碳值。